国家科技统计数据中心2016年经科技部批准筹建，2018年正式通过科技部建设评估。科技部对数据中心进行业务指导和委托，天津市科学技术局负责数据中心日常管理，天津市科学技术发展战略研究院统计监测部具体实施。

国家科技统计数据中心主要工作职责包括：承担科技部综合科技统计调查任务，包括科学研究和技术服务业非企业单位和转制为企业的研究机构科技活动统计调查、地方财政科学技术支出统计调查和国家级科技计划项目跟踪调查；负责建设和维护国家科技统计在线调查平台、中国科技统计指标数据库和中国科技统计网站等相关工作。